MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanocaldococcus sp. FS406-22 plasmid pFS01

Total Repeats: 100

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013888	A	6	6	66	71	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013888	TAA	2	6	89	94	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013888	AAAG	2	8	114	121	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013888	ATG	2	6	333	338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013888	T	6	6	341	346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013888	ATTT	2	8	359	366	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013888	TA	3	6	931	936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013888	TG	3	6	966	971	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013888	TAT	3	9	988	996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013888	GTG	3	9	999	1007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013888	A	6	6	1040	1045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013888	ACAT	2	8	1075	1082	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_013888	T	6	6	1125	1130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013888	ACCC	2	8	1150	1157	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
15	NC_013888	A	6	6	1196	1201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013888	TAA	2	6	1214	1219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013888	A	7	7	1274	1280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013888	TCC	2	6	1364	1369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_013888	AAC	2	6	1385	1390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013888	TA	3	6	1398	1403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013888	TCC	2	6	1435	1440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_013888	AG	3	6	1478	1483	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013888	TCC	2	6	1504	1509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_013888	AAG	2	6	1542	1547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013888	TCC	2	6	1574	1579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_013888	AT	3	6	1607	1612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013888	TAG	2	6	1617	1622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013888	TCC	2	6	1642	1647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_013888	A	6	6	1744	1749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013888	TAA	2	6	1750	1755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013888	ATC	2	6	1873	1878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013888	TTTA	2	8	1954	1961	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013888	TA	3	6	1974	1979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013888	T	6	6	1983	1988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013888	TA	3	6	1991	1996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013888	TTGG	2	8	2042	2049	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013888	TTA	2	6	2066	2071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013888	TAA	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013888	AAT	2	6	2124	2129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013888	TAAA	2	8	2153	2160	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013888	TTA	2	6	2190	2195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013888	TTA	2	6	2199	2204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013888	AAC	2	6	2247	2252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013888	CAAA	2	8	2258	2265	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_013888	A	6	6	2276	2281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013888	ATT	2	6	2310	2315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013888	T	7	7	2350	2356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013888	ACA	2	6	2421	2426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013888	ATT	2	6	2751	2756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013888	CCA	2	6	4054	4059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_013888	TAAA	2	8	4101	4108	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013888	AC	3	6	4143	4148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_013888	TGT	2	6	4179	4184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013888	T	6	6	4184	4189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013888	GTG	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013888	GTTT	3	12	4202	4213	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013888	AAT	2	6	4237	4242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013888	CGT	2	6	4259	4264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013888	ACG	2	6	4283	4288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_013888	AT	3	6	4321	4326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013888	AT	3	6	4508	4513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013888	GTT	2	6	4515	4520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013888	AT	3	6	4524	4529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013888	TCC	2	6	4573	4578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_013888	CCT	2	6	4584	4589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_013888	AG	3	6	4647	4652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013888	TA	4	8	4653	4660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013888	A	6	6	4675	4680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013888	T	6	6	4693	4698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013888	TA	3	6	4823	4828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013888	GAG	2	6	4845	4850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013888	TTA	2	6	4879	4884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013888	A	6	6	4967	4972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013888	TGGA	2	8	5012	5019	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013888	GATA	2	8	5043	5050	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013888	TA	3	6	5049	5054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013888	AGATT	2	10	5081	5090	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013888	ATAG	2	8	5154	5161	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013888	TTA	2	6	5204	5209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013888	AT	4	8	5238	5245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013888	TAG	2	6	5262	5267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013888	TA	4	8	5336	5343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013888	TTA	2	6	5638	5643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013888	TAATA	2	10	8027	8036	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013888	TATAT	2	10	8037	8046	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013888	CTG	2	6	8054	8059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013888	T	6	6	8407	8412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013888	TAG	2	6	9115	9120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013888	CTG	2	6	11761	11766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013888	TTA	2	6	11818	11823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013888	TAA	2	6	11828	11833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013888	TG	3	6	11889	11894	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013888	GAA	2	6	11929	11934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013888	A	6	6	11940	11945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013888	GTT	2	6	11965	11970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013888	AAAG	2	8	12013	12020	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013888	A	6	6	12049	12054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013888	ATTTG	2	10	12127	12136	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013888	AG	3	6	12146	12151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013888	GTT	2	6	12152	12157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.